Фамилия Игонин происходит от производных форм имени Игнатий, которое в переводе с латинского означает «неведомый» или «огненный». Основой послужило мирское имя Игон или его уменьшительный вариант Игоня. В старину имя Игнатий считалось простонародным, о бедняке даже говорили в шутку: «Живет Игошка: есть собака да кошка». Такая поговорка закрепилась за носителями имени, подчеркивая скромное, небогатое происхождение.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — игонин, то есть сын Игони. Этот суффикс характерен для русских фамилий, образованных от личных имён, прозвищ или названий профессий, оканчивающихся на -а или -я. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще возникали от имён на твёрдый согласный, -ин типичен для «материнской» или уменьшительной основы.

Стоит обратить внимание на региональную привязку. Фамилия Игонин встречается преимущественно в центральных и северных областях России, в частности в Нижегородской, Костромской и Вологодской губерниях. Это не случайно: именно там были распространены уменьшительные формы канонических имён, которые в официальных документах нередко заменяли полное имя. Так, в писцовых книгах XVI–XVII веков можно встретить крестьян и посадских людей с именем Игоня, что указывает на демократичность и повсеместность такого именования.

Таким образом, фамилия Игонин — не аристократическая, а исконно крестьянская или мещанская. Она не связана с каким-либо ремеслом или прозвищем по характеру, а целиком восходит к личному имени, которое в народе звучало проще и короче, чем полный церковный вариант Игнатий. Потомок человека по имени Игон или Игоня со временем и получил фамилию Игонин.