Фамилия Икенов — редкий случай, когда русская фамилия образована не от славянского корня, а от тюркского имени. Её основа — мужское имя Икен, которое в тюркских языках (особенно в казахском, башкирском, татарском) означает «близнец» или «двойня». Слово «ике» (или «икен») буквально переводится как «два», «двойной». Имя давали одному из близнецов, чтобы подчеркнуть его парность с братом или сестрой, — распространённый обычай у тюркских народов, где детей-двойняшек называли парными именами (второго могли назвать Кушкар, «парный»).

Русский суффикс -ов в фамилии Икенов — классический патронимический показатель, означающий «сын Икена» или «потомок Икена». Такое оформление типично для фамилий, возникших в среде тюркоязычных народов, которые попали под русское административное и церковное влияние в XVI–XIX веках. Когда крещёных татар, башкир или казахов записывали в метрики, их отчества часто русифицировали: Икен становился Икеновым.

Географически фамилия Икенов встречается в основном в Поволжье (Татарстан, Башкортостан), на Южном Урале и в западном Казахстане. Встречаются варианты написания Икинов (с чередованием е/и, что свойственно тюркским диалектам) и Икенев (редкая форма с суффиксом -ев, если основа оканчивалась на мягкий согласный). Носители фамилии — почти всегда потомки тюркских народов, причём не обязательно мусульман: многие были крещены, отсюда и русское окончание.

Стоит отличать Икенова от похожей фамилии Иконов (от греческого «икона») — у них разная этимология и ареал. Икенов — однозначно тюркская фамилия, и её носитель может с высокой вероятностью проследить свои корни до близнецового прозвища предка.