Фамилия Ильина — одна из тех, что образованы от мужского крестильного имени Илья. Это каноническая, церковная форма древнееврейского имени Eliyahu, которое переводят как «мой Бог — Господь» или «мой Бог — Яхве». Имя стало широко известным благодаря библейскому пророку Илье, легендарной фигуре в иудейской и христианской традиции. В народном сознании Илья-пророк слился с языческим громовержцем Перуном: его называли Ильей Громоносным, а его день — 2 августа — до сих пор считается «грозным» праздником.

Сама фамилия по модели образования — притяжательное прилагательное с суффиксом -ин. Это типичная патронимическая форма, отвечающая на вопрос «чей?»: Ильина — значит «дочь или жена Ильи». В крестьянской среде такие фамилии закреплялись за потомками, указывая на имя главы семьи. То есть любой носитель фамилии Ильина — прямой потомок человека по имени Илья.

В истории России известно несколько дворянских родов Ильиных. Самый древний из них ведет начало от Дмитрия Ивановича, последнего князя Галицкого, жившего в конце XIV века. Сами же князья Галицкие, согласно Бархатной книге, вели свой род от великого князя Владимира Святославовича, крестившего Русь. В XVII веке Ильины служили стольниками, стряпчими и воеводами. Этот род внесен в VI часть родословных книг Тульской и Рязанской губерний. Его герб — щит с золотым полем, на котором изображен черный одноглавый орел с короной, держащий в правой лапе меч, а в левой — пушку; щит покрыт мантией и шапкой, принадлежащими княжескому достоинству. Основателем другого рода Ильиных был дворцовый ключник Тимофей Ильин, сын которого, Денис, во второй половине XVII века стал стольником. Этот род внесен в III часть родословной книги Тверской губернии.

Среди известных представителей фамилии — Андрей Ильин, русский иконописец XVII века; Николай Иванович Ильин (1773—1823), русский драматург и переводчик; Петр Петрович Ильин (1886—1950), предприниматель, владелец завода, выпустившего в 1904 году первый автомобиль в России.