Фамилия Илькишиева — редкий пример фамилии, образованной от полного тюркского имени, а не от прозвища или профессии. В её основе лежит мужское личное имя Илькиш (варианты: Илькеш, Ильгиш), которое состоит из двух корней: «иль» (народ, страна, родина) и «киш» (человек, лицо). Таким образом, Илькиш буквально означает «человек народа» или «свой человек», что могло быть пожелательным именем — родители хотели, чтобы ребёнок рос уважаемым, близким к своему окружению.

Суффикс «-ев» (в женском варианте — «-а») указывает на русский способ оформления фамилии: к тюркской основе добавили типичный русский патронимический суффикс. Это значит, что Илькишиевы — это потомки человека по имени Илькиш. Такая модель (тюркское имя + русский суффикс) характерна для народов Поволжья, особенно татар и башкир, которые в XIX — начале XX века массово получали фамилии по отцу через русскую администрацию.

Географически фамилия тяготеет к Оренбургской области и Башкортостану. Если обратиться к спискам населённых пунктов, то, например, в Оренбуржье есть село Илькино, а сама фамилия встречается в документах переписей именно в этих краях. Это подтверждает её локальный, южно-уральский характер.

Стоит обратить внимание на двойной суффикс «-иш-ев». В отличие от простых фамилий вроде Илькин (от Илька), форма Илькишиев сохранила полную основу имени с аффиксом «-иш». В тюркских языках этот аффикс часто придаёт имени ласкательный или уменьшительный оттенок, но в данном случае он стал частью корня. Поэтому фамилия звучит более архаично и полно, чем если бы её сократили до «Илькин».

Сословно Илькишиевы, скорее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам, реже — к тептярям (сословие, платившее подати, но не приписанное к дворянству). Дворянских родов с такой фамилией в исторических гербовниках нет. Это типичная «народная» фамилия, которая не потеряла связи с исходным именем-пожеланием.