Фамилия Илькина — одна из тех, где за простым звучанием скрывается сразу несколько версий происхождения, и выбрать единственную непросто. Самое очевидное объяснение ведет к прозвищу Илька, которое могло возникнуть от названия пушного зверька — ильки, или куницы-рыболова. Этот зверь обитает в Северной Америке и ценится за мех, так что предок Илькиных вполне мог быть охотником или торговцем пушниной.

Однако есть и другая линия. Прозвище Илек, от которого тоже могла образоваться фамилия, связывают с карачаево-балкарским словом «иелик» — «владычество». В таком случае Илькой называли человека зажиточного, влиятельного, возможно, старосту или хозяина. Тюркский след прослеживается и в третьей версии: древнее мужское имя Илькай. Оно складывается из корня «иль» (страна, народ) и ласкательного суффикса -кай, то есть буквально означает «мой народ» или «народный». Имя было распространено у татар и других тюркских народов.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: чей? — Илькин, то есть сын или потомок Ильки. Такая форма характерна для фамилий, возникших в северных и центральных областях России, где суффикс -ин преобладал над -ов. Географически Илькины чаще встречаются в Поволжье и на Урале — как раз в зоне активных контактов с тюркским населением. Это косвенно подтверждает, что наиболее вероятная версия — тюркское происхождение имени-основы, хотя и «пушной» вариант отбрасывать не стоит: прозвища по животным в русской традиции очень часты.