Фамилия Ионцевы — одна из тех, что образована от имени, но не напрямую, а через промежуточную форму. В основе лежит каноническое церковное имя Иона. В переводе с древнееврейского оно означает «голубь», хотя в библейской традиции закрепилось и другое значение — «терпеливый» (по сюжету о пророке Ионе, проведшем три дня во чреве кита).

От полного имени Иона в русском быту возникли уменьшительные варианты. Один из них — Ионец. Суффикс -ец здесь указывал на принадлежность или ласкательное отношение. Так могли называть младшего в роду или просто человека, носившего имя Иона. А уже от этого прозвища-полуимени по стандартной модели образовалась фамилия: Ионец → Ионцев, то есть «сын Ионца» или «потомок человека по прозвищу Ионец».

Интересно, что фамилия могла закрепиться и с другим ударением — Ионцо́в. В некоторых говорах суффикс -ец давал беглую гласную, и форма «Ионец» превращалась в «Ионца» (родительный падеж). Отсюда и вариант фамилии, где основа звучит как Ионц-. Оба написания встречаются в документах, но форма Ионцев — более распространённая и литературная.

Точное время возникновения фамилии назвать сложно. Процесс шёл несколько столетий, и окончательно фамилии у крестьян закрепились лишь к концу XIX века. Однако имя Иона было популярно в среде духовенства, поэтому не исключено, что первые носители фамилии Ионцевы были выходцами из церковной или монашеской среды. В любом случае, фамилия эта — живая память о давнем имени, которое когда-то давали в честь библейского пророка.