Фамилия Иосипеко — редкий случай, когда в основе лежит не народная форма имени, а его полная церковная версия. Имя Иосиф (др.-евр. «Йосеф» — «Бог прибавит») в русской среде обычно превращалось в Осипа, а в украинской и белорусской — в Юзефа, Осипа или Йосипа. Форма Иосип — это прямая, почти книжная передача имени, без типичного для восточных славян смягчения или замены звуков. Такое написание указывает на то, что фамилия возникла в среде, где имя записывали по церковнославянскому образцу, вероятно, у священников или грамотных мещан, которые вели метрики.

Суффикс -енко — классический украинский патронимический показатель, означающий «сын» или «потомок». Вся конструкция Иосипеко буквально читается как «сын Иосипа». Это типичная модель для фамилий, возникших на территории Левобережной Украины, особенно в Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниях, где суффикс -енко доминировал с XVII века и почти полностью вытеснил другие способы образования фамилий у крестьян и казаков.

Обращает на себя внимание ударение. В украинских фамилиях на -енко оно чаще падает на предпоследний слог (Иоси́пенко), но написание Иосипеко без буквы «н» перед окончанием — это либо диалектный вариант (в некоторых говорах суффикс редуцировался до -еко), либо результат канцелярской ошибки при записи. Встречаются и параллельные формы: Иосипенко, Осипенко, Йосипенко. Фамилия Иосипеко сохранила редкую архаичную основу, поэтому её носители — скорее всего, потомки одного человека по имени Иосип, жившего в небольшом селе, где фамилия не успела «обкататься» до более привычного Осипенко.

Социально предки могли быть кем угодно: от казака до крестьянина, но сам факт использования полной, не народной формы имени намекает на то, что имя было дано по святцам и записано священником, а не в бытовом общении. Это не делает фамилию «духовной», но добавляет оттенок книжности в её происхождение. Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, сосредоточены в тех же регионах, где распространены все варианты на -енко от имени Осип — то есть в центральной и восточной Украине.