Фамилия Исакины (в мужском роде — Исакин) — одна из тех русских фамилий, в основе которой лежит церковное имя. Её образовали от библейского имени Исаак, что в переводе с древнееврейского означает «смеющийся». Согласно Ветхому Завету, такое имя получил сын Авраама и Сарры: Сарра рассмеялась, услышав пророчество о рождении сына в глубокой старости, отсюда и смысл имени.

По сути, Исакины — это потомки человека по имени Исаак. Фамилия построена по самой распространённой в русском языке модели: к основе имени добавляется суффикс -ин, который указывает на принадлежность («чей?» — Исакин, то есть сын Исаака). Такой способ словообразования типичен для северных и центральных областей России.

На Руси библейские имена давали не случайно: считалось, что имя влияет на судьбу. Исаак — имя нечастое в крестьянской среде, чаще оно встречалось в среде духовенства или старообрядцев. Поэтому можно предположить, что предки Исакиных могли быть либо выходцами из церковной среды, либо людьми, получившими имя по святцам в честь святого Исаакия Далматского (день памяти 30 мая по старому стилю).

В некоторых говорах имя Исаак произносили как Исак, откуда пошли фамилии Исаков, Исаковы. Вариант Исакин с суффиксом -ин встречается реже, что делает фамилию более локальной. Точную географию бытования назвать сложно, но по данным современных справочников, носители фамилии Исакины встречаются в Поволжье и на Урале.

Фамилия не получила широкой известности в дворянских родословных — скорее всего, предки Исакиных были крестьянами или мещанами. В документах XIX века упоминания об Исакиных встречаются в метрических книгах церквей Саратовской и Вятской губерний.