Фамилия Ишкин в большинстве случаев восходит к тюркско-татарскому имени Ишкиня, которое переводится как «только ровня», «друг», «товарищ». В русской повседневной речи это имя сократили до краткой формы Ишка — так на Руси нередко «обрубали» длинные иноязычные имена, добавляя к ним фамильный суффикс -ин. Получается, что Ишкин буквально означает «сын Ишки» или «потомок Ишкини».

Суффикс -ин в этой фамилии указывает на принадлежность: он типичен для русских фамилий, образованных от основ на -а, -я. Модель простая: Ишка → Ишкин. Такая схема встречается повсеместно, но в случае с Ишкиным важно, что основа не славянская, а заимствованная из тюркских языков. Это говорит о том, что предки носителя фамилии могли жить в зоне русско-татарского пограничья — например, в Поволжье, Приуралье или на южных рубежах Московского государства, где активно смешивались русские и тюркские роды.

Встречается и другая, менее вероятная версия: что Ишка — это производное от славянского имени Исаак (через уменьшительную форму Иска или Иша). Но она слабее, поскольку в русских говорах форма «Ишка» для Исаака не зафиксирована, а вот тюркское имя Ишкиня реально существует в ономастике татар и башкир. Поэтому первая гипотеза надёжнее.

Географически фамилия Ишкин нередка в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. В дореволюционных метрических книгах встречаются Ишкины среди крестьян и мещан, но сословной монополии на фамилию не было — её могли носить и служилые татары, и казаки.

Известных носителей с этой фамилией в публичном поле немного, что неудивительно: фамилия редкая, локальная. Если вы ищете свои корни, стоит начать с архива той губернии, где фамилия фиксируется чаще всего — например, Уфимской или Казанской.