Фамилия Ишкова образована от имени Ишка, которое является просторечной формой тюркско-татарского имени Ишкиня, что в переводе на русский язык означает «только ровня, друг, товарищ». Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын стал настоящим мужчиной и верным другом. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ишковых можно лишь на основании генеалогических исследований.