Фамилия Искендир — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет абсолютно прозрачную восточную основу. Её ядро — мужское имя Искандер (арабская форма имени Александр, которую принес на Восток Александр Македонский, известный в исламском мире как Искандер Зуль-Карнайн). В тюркских языках, особенно в кавказских и среднеазиатских, имя закрепилось в форме Искендир или Искандер.

Словообразовательная модель здесь необычна. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, которые образуются от отчества или прозвища отца, фамилия Искендир стоит в чистой, «голой» форме, без суффикса. Это характерно для фамилий, которые вошли в русский обиход из языков Северного Кавказа, Закавказья или тюркской среды, где фамилии часто представляют собой просто имя предка. Носитель такой фамилии — потомок человека по имени Искендир.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где сильно влияние кумыкского, азербайджанского или дагестанских языков: это Дагестан, Чечня, Азербайджан, а также тюркские народы Ставрополья. Встречается она и у крымских татар. В русском написании могла закрепиться через делопроизводство XIX века, когда при переписях или рекрутских наборах имя отца записывали как фамилию сына без изменений — так появились «Искендир», а не «Искендиров», что для русского уха звучит непривычно.

Интересная деталь: в некоторых тюркских диалектах форма «Искендир» — это не просто вариант «Искандера», а народная этимология, где имя переосмыслили как «человек, который пришёл» (от тюркского «келди» — пришёл). Но это вторичное толкование, лингвистически более надёжна связь с греческим Александром через арабское посредничество.

Сословно фамилия не привязана к дворянству или крестьянству — её носителями могли быть и уздени (свободные общинники на Кавказе), и духовные лица, и торговцы. Главное, что объединяет всех Искендиров, — предок по мужской линии носил имя в честь легендарного завоевателя, что на Востоке считалось почётным и давало надежду на силу и удачу.