Фамилия Исянтаев — редкий пример того, как тюркское имя, попав в русскую среду, обросло сразу двумя суффиксами: сначала -тай, а потом -ев. Это сразу указывает на регион бытования: скорее всего, южный Урал, Башкортостан, Оренбуржье или Татарстан, где фамилии на -таев (-таев) встречаются часто (Абдултаев, Ибрагимтаев), но Исянтаев стоит особняком из-за редкой основы.

В основе лежит башкирское или татарское мужское имя Исянтай. Оно составное: первая часть «исән» (здоровый, невредимый, благополучный) — распространённый компонент в тюркских именах-пожеланиях (ср. Исәнбай, Исәнгилде). Вторая часть «тай» — уменьшительно-ласкательный аффикс, характерный для антропонимии тюркских народов (буквально «жеребёнок», но в именах он теряет прямое значение и служит для образования ласкательных форм). Таким образом, Исянтай — «здоровенький», «благополучный малыш»; имя давали с надеждой, что ребёнок вырастет крепким и без болезней.

Русская фамилия образовалась по стандартной модели: к основе Исянтай добавили патронимический суффикс -ев (как в Иванов от Иван). Встречаются варианты написания через «а» (Исянтаев) и через «я» (Исянтяев), но первый закреплён в официальных документах чаще. В дореволюционных записях фамилия могла фиксироваться как Исянтаевъ.

Сословно носители фамилии — скорее всего, башкиры или татары из числа тептярей или государственных крестьян, реже — казаки. Дворянских родов с такой фамилией не известно: она не попала в «Общий гербовник». В метрических книгах XIX века Исянтаевы встречаются в деревнях Белебеевского и Стерлитамакского уездов Уфимской губернии — это основной ареал.

Сравните с однокоренными фамилиями: Исянбаев (от Исянбай — «богатый здоровьем»), Исянгулов (от Исянгул — «раб благополучия»). Исянтаев отличается тем, что в основе — именно ласкательная форма, а не полное имя с титульным компонентом («бай», «бик»). Это делает фамилию более «домашней» по происхождению: предка звали не вельможным Исянбаем, а просто Исянтаем — «здоровячком».