Фамилия Иваненко — один из ярких примеров украинской модели фамильного образования. Суффикс -енко, который в ней присутствует, в украинской ономастике традиционно указывал на «маленького», то есть сына, потомка человека, названного в основе. В данном случае основа — Иван, народная форма канонического имени Иоанн, которое пришло на Русь вместе с христианством. В переводе с древнееврейского оно означает «милость Божья». Таким образом, исходное значение фамилии — «сын Ивана» или «потомок Ивана».

Имя Иван на протяжении нескольких столетий, с XVI по XIX век, оставалось самым частым в России: среди крестьянства оно охватывало от 15 до 25% всех мужчин. Именно поэтому фамилии с основой Иван- — одни из самых распространённых у русских, украинцев и белорусов. Но если на севере и в центральной России преобладали формы на -ов (Иванов), то на украинских землях закрепился именно суффикс -енко, который в XVI–XVII веках стал почти универсальным маркером фамилии, вытеснив более ранние отчества.

Стоит отметить, что не все носители фамилии Иваненко — выходцы из крестьянской среды. Существует документально зафиксированный дворянский род Иваненко. Его герб внесён в восьмую часть «Общего гербовника дворянских родов Российской империи», что указывает на более позднее, чем обычно, пожалование дворянства — за выслугу или заслуги, а не за древность происхождения. Это значит, что среди предков некоторых Иваненко могли быть казацкие старшины или чиновники, получившие потомственное дворянство в XVIII–XIX веках.

Географически фамилия Иваненко чаще всего встречается в центральных и восточных областях Украины, а также в южных регионах России, куда шла активная миграция украинского населения в XVIII–XIX веках. В современном русском языке фамилия не склоняется, если принадлежит мужчине (Иваненко пришёл), и склоняется, если речь о женщине (у Иваненко нет). Эта особенность — ещё одно напоминание о её украинском происхождении, где фамилии на -енко исторически были неизменяемыми.