Фамилия Изибаева хранит память о порядке рождения детей в тюркской семье. Её основа — мужское имя Изибай, которое складывается из двух частей: «изи» (очередной, следующий) и «бай» (господин, богач, хозяин). Имя давали второму по счёту мальчику: если после рождения сына в семье снова рождался сын, его нарекали Изибаем, то есть «очередным баем» или «следующим мальчиком».

Имя Изибай — не единственное в ряду подобных тюркских имён. В той же логике образованы имена Тунгатар (первый родившийся), Кинджебай (младший бай), Алтынбай (золотой бай). Все они указывали на очерёдность или ценность ребёнка для рода.

Фамилия образована по русской модели: к основе Изибай добавили суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного) и окончание -а, указывающее на принадлежность к женской линии или на форму в родительном падеже. В мужском варианте фамилия звучит как Изибаев. Такая модель типична для фамилий тюркского происхождения, которые оформились у башкир, татар, казахов и других народов после вхождения в состав Российской империи.

Географически фамилия Изибаева встречается преимущественно в Башкортостане и соседних регионах Урала и Поволжья. Это подтверждает её связь с башкирской и татарской ономастикой, где имя Изибай было распространено в XVIII–XIX веках.

Словообразовательный разбор показывает, что фамилия не связана с ремеслом или прозвищем по внешности — она целиком восходит к личному имени. Это делает её типичным примером патронимической фамилии, где родовое имя закрепилось за потомками без изменений.