Фамилия Изибаев — один из тех случаев, когда в основе лежит не прозвище или профессия, а порядок рождения. Её образовали от тюркского мужского имени Изибай. Если в семье после первенца-мальчика рождался ещё один мальчик, его могли наречь именно так: «очередной бай», то есть следующий господин или хозяин. «Бай» в тюркских языках — титул зажиточного, уважаемого человека, но в именах он часто выступал как пожелание благополучия, а не указание на реальный статус. Имя Изибай давали не столько в честь богатства, сколько по порядку: «следующий мальчик».

Словообразовательная модель проста и прозрачна: к основе Изибай добавили русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого или йотированного окончания). Так на стыке тюркской именной традиции и русской фамильной системы появилась фамилия Изибаев. Подобный способ — взять полное имя отца и приклеить суффикс принадлежности — типичен для большинства русских фамилий, но в данном случае он закрепил именно прозвищно-именную, а не крестильную основу.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где тюркские имена смешивались с русским делопроизводством: Башкортостан, Татарстан, Оренбуржье. В башкирской и татарской среде имя Изибай встречается в записях XIX века, но как фамилия оно относительно редкое. В словарях тюркских имён (например, у Гафурова или Кусимовой) можно найти разбор имени Изибай, а вот в обобщающих ономастических справочниках по русским фамилиям его обычно нет — фамилия остаётся на периферии внимания исследователей.

Стоит добавить, что написание с буквой «з» (Изибаев) не единственное: в документах встречается вариант Исибаев, где «с» отражает глухое произношение в некоторых тюркских говорах. Но основной, закрепившийся в паспортах вариант — через «з». Фамилия не получила широкого распространения за пределами Урало-Поволжья, и в современных телефонных справочниках или базах данных её носители исчисляются скорее десятками, чем сотнями.