Фамилия Изоскин образована от имени Изоска — это разговорная форма крестильного мужского имени Иосиф. В быту имя Иосиф, означающее в переводе с древнееврейского «Бог приумножит», звучало как Осип, а в народной речи превращалось в Изос, Изоска. Аналогично из Иосифа вышли фамилии Осипов, Осипенко, Иосифов, а Изоскин стоит в том же ряду, но встречается гораздо реже.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Изоскин — буквально «сын Изоски». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а, -я. В отличие от более массовой модели на -ов, фамилии на -ин чаще встречаются в северных и центральных областях России, но для Изоскиных нет чёткой географической привязки — фамилия редкая и рассеянная.

Интересно, что в некоторых говорах «изос» могло быть и самостоятельным прозвищем, связанным с диалектным глаголом «изосить» — косить, клонить набок. Так могли прозвать человека с неровной походкой или кривым плечом. Однако эта версия менее вероятна: прямое происхождение от имени Иосиф надёжнее подтверждается словообразованием и параллелями в других фамилиях.

Среди носителей фамилии Изоскин известны выходцы из крестьянской среды — в XIX веке она фиксируется в переписных книгах Вятской и Костромской губерний. Встречаются также варианты написания Изоскин и Изозкин, но первая форма — основная и исторически устойчивая.