Фамилия Изоткина — женская форма фамилии Изоткин, и её разумнее всего разбирать с мужского варианта. В основе лежит имя Изотка, которое в русской народной традиции является уменьшительно-ласкательной формой от крестильного имени Изот (церковное Зотик). Само имя Зотик — греческого происхождения, от «зотикос» — «животворящий», «дающий жизнь». В святцах почитается святой Зотик Сиротопитатель, римский вельможа, который выкупал и выхаживал больных и сирот.

Модель образования фамилии проста и типична для севера и центра России: суффикс -ин присоединялся к основам на -а, -я. Изотка (в диалектном произношении могло звучать и как Изотко) дало Изоткин — «чей?» — «сын Изотки». В документах XV–XVII веков такие фамилии на -ин фиксировались в первую очередь у крестьян и посадских людей, реже у духовенства. Фамилия Изоткин, а значит и Изоткина, — не дворянская и не купеческая, а народная, крестьянская по происхождению.

Географически фамилия чаще встречается в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — в тех регионах, где имя Изот (Зот) было особенно популярно в XVI–XVIII веках. В этих местах имена в бытовом обиходе часто «укорачивали»: Изот превращался в Зотку, Изотку, Зотя. Поэтому Изоткины — это потомки человека, которого в деревне звали ласково Изотка, а по документам он числился, скажем, Изотом Степановым сыном.

Интересная деталь: в некоторых говорах имя Изотка могло стать прозвищем для человека с каким-то ярким, «животворящим» характером — бодрого, деятельного, жизнелюбивого. Однако прямое, документальное происхождение от церковного имени надёжнее, чем прозвищная версия, поэтому основным путём образования фамилии остаётся отчество от крестильного имени.