Фамилия Кабекенова — яркий пример фамилий, образованных на стыке тюркских языков и русской грамматики. Её основа — мужское имя Кабекен, которое само по себе является сложным и показательным для казахской (и шире — тюркской) антропонимии.

Корень имени — «Кабе» или «Каба». В казахском языке «каба» (қаба) может означать «слой», «пласт», «складка», но в антропонимии это слово чаще связывают с арабским «кабир» — «великий», «большой», либо с древнетюркским «каба» — «отец», «предок». Однако правдоподобнее другая версия: имя Кабекен — это форма имени Каби (сокращение от Кабир) с добавлением уменьшительно-ласкательного аффикса «-кен», очень распространённого в казахских именах (например, Еркен, Серкен). Таким образом, Кабекен буквально означает «маленький Каби» или «Каби, которого ласково называют».

Суффикс «-ова» — типично русский, указывающий на принадлежность. В русской традиции фиксации фамилий в документах XIX–XX веков к тюркским именам и прозвищам добавляли именно этот суффикс, чтобы образовать фамилию для женщины (Кабекенова) и мужчины (Кабекенов). Это говорит о том, что предок носительницы фамилии был казахского или другого тюркского происхождения, а его имя (или прозвище) Кабекен было зафиксировано в метрических книгах, списках или переписи населения Российской империи.

Фамилия эта довольно редкая. Географически она почти наверняка привязана к Казахстану или к районам России с компактным проживанием казахов (Астраханская, Оренбургская, Омская области). В отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Смирнов, Кабекенова не разбросана по всей стране — её носители, скорее всего, связаны общим родом из конкретного аула или региона.

Если посмотреть на словообразовательную модель, то перед нами не прозвище от ремесла или внешности, а чисто патронимическая фамилия — от личного имени. Это значит, что предок был не «кузнецом» и не «рыжим», а просто человеком по имени Кабекен. В этом смысле фамилия сохраняет прямую связь с именем основателя рода, что для тюркских фамилий характерно: многие из них образованы от имён, а не от профессий.