Фамилия Кабекова — женская форма фамилии Кабеков, которая образована по русской модели с суффиксом -ов. Основа здесь — Кабек, а вот с её происхождением не всё однозначно. В русских фамилиях суффикс -ов чаще всего указывает на «сына такого-то» или «принадлежащего такому-то», так что Кабеков — потомок человека по имени или прозвищу Кабек.

Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В татарском, башкирском и других тюркских языках слово «кабек» или «кабик» могло означать «корочка», «шелуха», «чешуя» или даже «пенка на молоке». Такие прозвища в народе давали по внешности, характеру или занятию: например, человеку с сухой кожей, либо тому, кто занимался переработкой зерна или рыбы. В Поволжье и Приуралье, где русские и татары веками жили рядом, тюркские основы в русских фамилиях — обычное дело. Фамилия Кабекова встречается у русских, татар и башкир, что подтверждает эту связь.

Менее распространённая гипотеза — от имени Кабек как уменьшительной формы от канонического имени Яков (через диалектное «Каб»). Но звуковой переход неочевиден, а письменных подтверждений такой версии мало. Ещё реже фамилию связывают с коми-пермяцким словом «каб» — «колено» или «изгиб», но это уже совсем локальная гипотеза.

Географически фамилия Кабекова (и Кабеков) чаще всего фиксируется в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Это регионы, где пересекались славянские и тюркские миры, и фамилия вписалась в местный ономастикон без видимых изменений. Сословно предки Кабековых могли быть и крестьянами, и мещанами, и служилыми людьми — фамилия не несёт дворянского оттенка, но и не указывает на низкое происхождение.

В написании фамилии интересна буква «е» в корне: в тюркских языках звук мог произноситься как нечто среднее между «и» и «э», а русское письмо закрепило «е». Вариант «Кабикова» встречается, но реже — он мог возникнуть под влиянием других фамилий на -иков.