Фамилия Качакова отталкивается от прозвища Качак. Самая прямая версия ведет к татарскому слову «качак» — «беженец», «беглец». Если это так, то первый носитель прозвища был человеком пришлым, возможно, покинувшим родные места по своей воле или вынужденно. В русских говорах слово «качак» не закрепилось, поэтому татарский корень выглядит наиболее убедительным.

Менее вероятная, но всё же возможная версия связывает прозвище с нарицательным «кача» — «утка». В этом случае прозвище могли дать человеку, который разводил или пас уток. Такие прозвища по роду занятий встречаются нередко, но для фамилии Качакова утиная тема — скорее исключение, чем правило.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Качак добавили суффикс -ов, а затем женское окончание -а. Это типичная патронимическая фамилия, то есть указывающая на отца: Качаков — сын Качака. В женском варианте она сохранила ту же форму без изменений, что характерно для русских фамилий на -ов/-ев.

С точки зрения географии фамилия Качакова встречается в разных регионах, но без ярко выраженного ареала. Это говорит о том, что носители расселились достаточно широко, но не образовали плотных локальных гнёзд. Сословная принадлежность предков могла быть разной: от крестьян до служилых людей, но точных данных по конкретным родам нет.

Интересно, что фамилия Качакова не имеет однозначных «двойников» среди других русских фамилий. Близкие по звучанию Качалов или Качурин образованы от других основ и не пересекаются по смыслу. Это делает Качакову более редкой и менее тиражированной фамилией, что для её носителей может быть поводом для гордости.