Фамилия Качикин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от прозвища или имени через суффикс принадлежности -ин. Суффикс указывает на то, что родоначальника звали Качика, а его потомки стали Качикиными. Основа фамилии — слово «качка» или «качок», но не в современном значении (человек с развитой мускулатурой), а в старом, диалектном.

В русских говорах «качкой» называли утку, причём не любую, а домашнюю или, реже, нырковую породу. Прозвище Качика мог получить человек, чем-то напоминавший эту птицу: например, характерной походкой вразвалку, приземистой фигурой, любовью к воде или даже привычкой кряхтеть. Второй, менее очевидный вариант — связь с глаголом «качать». В некоторых областях «качей» или «качкой» называли того, кто укачивал детей, няню, или же мастерового, работающего на качалке (например, на маслобойне или рудничном подъёмнике). Третья версия отсылает к имени Касьян: в просторечии его переделывали в Качка или Кача, а уменьшительная форма Качика дала фамилию.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России — Архангельской, Вологодской, Костромской областям, где слово «качка» в значении «утка» было в ходу. Встречается она и в Поволжье, но реже. Сословной принадлежности у фамилии нет: Качикины могли быть и крестьянами, и мещанами, и купцами, — прозвище не указывало на профессию или статус, а описывало внешность или повадку.

Однокоренных фамилий немного: Качкин, Качалов, Качков. Качикин стоит особняком за счёт редкого суффикса -ик-, который превращает основу в уменьшительно-ласкательную форму. Это говорит о том, что прозвище Качика было не обидным, а скорее бытовым, домашним — так могли звать в семье или в деревне невысокого увальня.