Фамилия Качиковы, как и многие русские фамильные имена, образовалась от личного прозвища или мирского имени. В основе лежит слово «Качик», которое, скорее всего, связано с глаголом «качать». Наиболее вероятное объяснение — так в быту называли младенца, которого постоянно укачивали в люльке. Такие «колыбельные» прозвища были распространены в крестьянской среде и закреплялись за ребенком на всю жизнь.

Однако у фамилии есть и другие возможные корни. Прозвище Качик могло указывать на профессию: например, на няньку, укачивающую детей, или на человека, занятого откачкой воды. Ещё одна версия отсылает к местности: слово «качь» в некоторых говорах означало «трясина», «топь». В таком случае Качиковым могли прозвать того, кто жил у болота. Менее убедительна гипотеза, связывающая прозвище с «качом» — похлебкой из осиновой коры с мукой, которую ели в голодные годы; тогда прозвище могло закрепиться за бедняком.

Словообразовательная модель типична: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Качиковы — это дети, потомки Качика. Фамилия фиксируется в исторических документах: в работе С. Б. Веселовского упомянут Качиков Лука, живший в 1480 году. Это одна из ранних записей, подтверждающая древность рода. Несмотря на обилие версий, основная линия ведёт к прозвищу, данному по действию — укачиванию, что делает фамилию Качиковы ярким примером того, как бытовые детали жизни предков становились основой для родового имени.