Фамилия Каконина — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд в ней слышится что-то звукоподражательное или даже детское, но на деле её корень уходит в древнерусские прозвища и крестильные имена.

Основа фамилии — прозвище Какона. В русских говорах слово «какона» или «кокона» имело значение «курица», «наседка». В переносном смысле так могли назвать суетливую, хлопотливую женщину или, наоборот, чрезмерно заботливого, «квохчущего» мужчину. Прозвища по птицам были распространены на Руси: они метко описывали внешность или характер человека без грубой обиды.

Однако есть и вторая, не менее вероятная версия. Какона — это производная форма от крестильного имени Никанор (в переводе с греческого «видящий победу»). В народе длинные имена часто сокращали: Никанор превращался в Никашу, Каню, а затем и в Какону. Уменьшительные формы на -оня (Никоня, Каконя) типичны для северных и центральных говоров. Если это так, то предок носителя фамилии был просто Никанором, которого в быту звали Каконей.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Каконин сын, то есть потомок Каконы. Такая модель образования — одна из древнейших в русских фамилиях, она закрепилась в основном в среде крестьян и посадских людей. Фамилия не дворянская, не семинарская и не искусственная — она выросла из живого обихода.

Географически фамилия Каконина встречается редко, но заметна в Вологодской и Кировской областях, а также в Поволжье. Это косвенно подтверждает обе версии: и северные говоры с их любовью к усечённым формам имён, и деревенский быт, где прозвища по животным и птицам были обычным делом. Спор между двумя корнями разрешить почти невозможно — в быту прозвище и сокращение имени могли слиться в один звук. Для носителя фамилии это означает, что его предок был либо «наседкой»-хлопотуном, либо Никанором, которого домашние звали ласково и коротко.