Фамилия Калэников — редкий случай, когда написание подсказывает произношение, а оно, в свою очередь, ведёт к неочевидной основе. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Калэ́ников. Буква «э» после «л» — ключевая зацепка. В русских фамилиях корень «Калэн-» с твёрдым «э» почти всегда указывает на заимствование или инородное происхождение основы, которое обрусело через суффикс -ов.

Самая прямая версия: фамилия образована от имени Калэн. Это вариант крестильного имени Каллиник (от греческого καλός νίκη — «прекрасная победа»). В просторечии «Каллиник» могло сократиться и измениться до «Калэн» — с твёрдым «э» на конце, как в украинских или южнорусских говорах. Суффикс -ик- в исходной форме отпал, осталась основа, к которой добавили типичный русский патронимический суффикс -ов. Таким образом, Калэников буквально значит «сын Калэна», то есть потомок человека по имени Калэн (из Каллиника).

Менее вероятная, но допустимая версия — от прозвища Калэный. В южных и западных диалектах «калёный» (с ударением на «ё») означает «раскалённый, закалённый». Прозвище могли дать кузнецу, работнику у горна или человеку с крутым, «огненным» нравом. Переход «ё» в «э» под ударением — явление редкое, но встречающееся в записях, когда писарь фиксировал фамилию на слух, не различая букв.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках Калэниковы встречаются в основном в Курской, Харьковской и Воронежской губерниях. Сословно — чаще крестьяне или мещане. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Обратите внимание на однокоренные фамилии: Калеников (с мягким «е»), Калениченко, Каленик. Все они восходят к тому же источнику — имени Каллиник. Разница в написании «е» или «э» — это не ошибка, а следствие местного произношения: в одних регионах имя звучало мягче, в других — твёрже. Фамилия Калэников — твёрдый вариант, который сохранил живую речь предков.