Фамилия Калиницкая — женская форма фамилии Калиницкий. Её основа восходит к крестильному имени Каллиник, что в переводе с греческого означает «добрый победитель» (kallos — красота, nike — победа). В православных святцах это имя носил раннехристианский мученик III века, и в народной среде оно давало множество производных форм. Именно от одной из таких обиходных версий — Калиня или Калин — и образована фамилия через суффикс -ицк(ий). Суффикс -ицк- характерен для фамилий польского, украинского и белорусского происхождения, а также для русских фамилий, возникших в западнорусских землях (например, на Смоленщине, в Брянщине).

В отличие от более частотного варианта Калининский (с суффиксом -инск-), Калиницкий — форма более редкая и локальная. Она могла указывать на принадлежность к определённому населённому пункту: к примеру, к селу Калинки или Калиновка, но в таком случае ожидался бы суффикс -овск-. Поэтому правдоподобнее версия, что фамилия не топонимическая, а патронимическая: Калиницкий — это «сын Калины» (от разговорной формы имени Калина, которая в народе часто смешивалась с названием растения). В украинской ономастике фамилия Калиницький напрямую связывается с именем Калина, а окончание -ицкий — типичный признак шляхетских фамилий Речи Посполитой.

Носители фамилии Калиницкая, скорее всего, происходят из западнорусских губерний или с территории современной Украины и Беларуси. В архивных документах XVIII–XIX веков эта фамилия встречается среди мещан и однодворцев южных уездов. В целом, фамилия редкая: по данным современных телефонных справочников, её концентрация заметна в Киевской и Житомирской областях, а также среди потомков переселенцев на Дальнем Востоке.