Фамилия Каллиева — редкий случай, когда её происхождение почти наверняка определяется суффиксом и географией, а не корнем. Женская форма Каллиева указывает на мужскую основу Каллиев, которая образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев. Этот суффикс присоединяли к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или на -й. В данном случае основа — Каллий, что сразу выводит нас за пределы славянского имяслова.

Самая вероятная версия — фамилия восходит к крестильному имени Каллий. Это мужское имя греческого происхождения (от «каллос» — красота), встречавшееся в святцах, но крайне редкое в быту. В России так могли назвать ребёнка в семье священника или в среде, ориентированной на греческую традицию. Фамилия Каллиев, таким образом, означает «сын Каллия» или «потомок Каллия». Приставка -а в женской форме — это просто грамматическое окончание, указывающее на принадлежность женщине.

Менее вероятна, но возможна версия от тюркского или кавказского корня: в некоторых языках «кал» означает «оставайся», «будь», а «лий» — «господин». Однако русский суффикс -ев в фамилии Каллиев — сильный аргумент в пользу того, что её принесли в Россию из греко-славянской среды, а не из тюркской. Если бы основа была тюркской и адаптированной, фамилия скорее получила бы суффикс -ов (Каллиов) или осталась без суффикса (Калли).

Социальный контекст: фамилии на -ев от редких канонических имён типичны для духовного сословия и для старообрядческих общин, где держались за старые, нераспространённые имена. Встретить Каллиева в крестьянской среде Центральной России маловероятно. Носители фамилии, скорее всего, потомки священнослужителей или людей, получивших имя по святцам в XIX веке.