Фамилия Калнишевская — один из тех случаев, когда географическая привязка оказывается надёжнее, чем разбор корня. Основа «Калниш» почти наверняка указывает на украинский или польский топоним. В первую очередь на ум приходит село Калныш (варианты — Калниш, Калныши) на Черкасчине или в Подолье. Суффикс «-евск-» с окончанием «-ая» выдаёт типично польскую или украинскую шляхетскую модель образования фамилий от названия владения: владелец Калныша становился Калнишевским, а его жена или дочь — Калнишевской. В русском языке окончание закрепилось как женское, но по происхождению это форма от мужской фамилии Калнишевский.

Словообразовательная модель здесь проста, но неочевидна. Корень «Калниш» может восходить к украинскому «калний» — грязный, или к «кал» в значении «грязь, болото». Это нередко для сёл, стоявших на низком берегу или у топи. Вторая версия — от диалектного «калныш» как названия глинистой почвы. В любом случае, фамилия не связана с именем или ремеслом, а указывает на место, откуда родом первый носитель. Спор между ойконимическим (от названия села) и топографическим (от характеристики местности) корнем решается просто: если село Калныш существует, версия с названием населённого пункта первична.

Калнишевская — фамилия редкая. В отличие от массовых Ковалёвых или Ивановых, она сохраняет региональную привязку к Правобережной Украине и юго-западным губерниям Российской империи. Встречается в основном среди потомков мелкой шляхты и казацкой старшины, которые в XVIII–XIX веках получали фамилии по имениям или хуторам. Известных носителей с этой фамилией в общероссийском масштабе нет, что типично для локальных дворянских или мещанских родов.

Интересная деталь: написание с «е» после «ш» (Калнишевская, а не Калнишовская) указывает на польское влияние в словообразовании. В польском суффикс «-ewski» в женском роде даёт «-ewska». Если бы фамилия формировалась в чисто русской среде, скорее появилась бы форма Калнишовская. Эта фонетическая особенность — маркер того, что предки носительницы фамилии жили на землях Речи Посполитой или в зоне культурного влияния польской шляхты.