Фамилия Калыбаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Калыбаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Калыбаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Калыбаев, вероятно, восходит к персидско-тюркскогому мужскому имени Калыбай, которое означает «родинкой, имеющий родинку». Поэтому если ребенок рождался с родинкой, ему давали соответствующее имя. В исторических документах под 1468 годом упоминается казанский богатырь Калыбай, пришедший на Украину. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Калыбаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Калыбаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.