Фамилия Канаушкин происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Канаушкин образована от прозвища Канаушка, которое ведет свое начало от топонима Канаушка. Так называется деревня в Красноярском крае. Вполне вероятно, что предок Канаушкин родился или долгое время жил в этом населенном пункте. Само название деревни, вероятно, восходит к имени первого поселенца – Канаушка. Это имя является производной русифицированной версией имени Канаш, которое в переводе с чувашского языка означает «совет». По другой версии, фамилия Канаушкин образована от просторечного варианта греческого имени Никанор (Никанор < Никаноша < Никаша < Кана < Канаша < Канауша < Канаушка). Это имя на русский язык переводится как «увидевший победу». Одним из святых покровителей имени Никанор считается апостол и диакон Никанор, совершавший богоугодные деяния вместе со своими соратниками, святыми апостолами и диаконами Прохором, Тимоном и Парменом. Дни памяти этого святого приходятся на 10 и 17 января. Возможно, что основатель рода Канаушкиных был человеком из простого сословия. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Канаушка, со временем получил фамилию Канаушкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Канаушкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Канаушкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.