Фамилия Канайчева — женская форма фамилии Канайчев, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В ней нет распространённого суффикса -ов или -ин, что сразу наводит на мысль о более редкой модели образования. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая от прозвища или имени с тюркским корнем.

Основа «Канай» восходит к тюркскому личному имени Канай. В тюркских языках «кан» означает «кровь» или «род», а уменьшительный аффикс -ай даёт значение «кровный», «родной», «единокровный». Имя Канай было распространено у татар, башкир и других народов Поволжья. В русской среде такое имя или прозвище могли дать человеку с восточными корнями либо приезжему из Казанского или Астраханского ханства. Суффикс -ев (в мужском варианте Канайчев) указывает на принадлежность: «сын Каная» или «из рода Каная».

Вторая версия менее вероятна, но допустима: «канай» могло быть диалектным прозвищем. В некоторых говорах «канать» означало «просить», «клянчить», а «канай» — попрошайка. Однако эта гипотеза слабая, так как суффикс -ай нехарактерен для русских прозвищ в этой функции, и в словарях русских говоров такое слово не фиксируется.

Фамилия Канайчева встречается преимущественно в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкирии, Оренбургской и Челябинской областях. Это говорит о региональной привязке к зоне активных русско-тюркских контактов. Носители фамилии могли быть крещёными татарами или русскими, получившими прозвище от соседей-инородцев.

Словообразовательная модель необычна: суффикс -ев присоединён к основе на -ай, что даёт двойной гласный в конце. Такие фамилии (ср. Алпайчев, Кудайчев) встречаются редко и почти всегда указывают на тюркское происхождение основы. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Кана́йчева.