Фамилия Канопка — одна из тех, что пришли в русский язык из чешской среды. Её основа — чешское мирское имя или прозвище Конопка, которое восходит к слову «konopka». Так в Чехии называют коноплянку, или реполова, — маленькую певчую птицу, похожую на воробья. Коноплянка получила своё название не случайно: она кормится семенами травянистых растений, особенно любит конопляные поля, отсюда и имя. Песня у неё сложная, с журчащими трелями, свистами и тресками.

В старину, когда человек жил в тесной связи с природой, такие прозвища по названиям птиц были распространены. Конопкой могли назвать человека за сходство с этой птицей — например, за негромкий, мелодичный голос, подвижность или особую привязанность к полям и лугам. Позже прозвище закрепилось как фамилия.

Форма Канопка, а не Конопка, — результат русской фонетики. В безударном положении гласный «о» в русском языке произносится как «а», поэтому при переносе фамилии в русскую среду написание изменилось под влиянием живого произношения. Такое явление часто встречается у фамилий, перешедших из западнославянских языков.

Чешская модель образования фамилий от мирских имён — одна из самых продуктивных. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые указывали на принадлежность отцу, чешские фамилии часто сохраняли исходное прозвище в чистом виде, без суффиксов. Канопка — как раз такой случай: это не патроним, а прямое прозвище, ставшее фамилией.

Встречается фамилия Канопка и в украинской среде, где тоже возможна адаптация чешского корня. Однако чешское происхождение остаётся основным и наиболее обоснованным: словарь Б. Унбегауна и другие ономастические работы указывают на связь с «konopka» именно через чешскую традицию.