Фамилия Каперцев — притяжательное прилагательное, образованное с помощью суффикса -ев от прозвища Каперец. Основа здесь — нестандартная: слово «капер» (морской разбойник с официальным разрешением) в русском языке известно, но суффикс -ец указывает на уменьшительную или пренебрежительную форму. То есть Каперцем могли назвать человека, который либо промышлял каперством, либо имел к этому занятию какое-то отношение — например, служил на каперском судне. Впрочем, в крестьянской среде, откуда происходит большинство русских фамилий, каперство — явление редкое. Поэтому правдоподобнее другая версия: прозвище образовано от диалектного глагола «капать» или «каперстить» — в некоторых говорах так называли человека, который капризничает, суетится или делает что-то невпопад. Суффикс -ец в таком случае придаёт прозвищу оттенок насмешки: Каперец — «капризуля», «суетливый».

Географически фамилия редкая. Основной ареал её бытования — юг России и Украина, где фамилии с суффиксом -ец встречаются чаще, чем в северных областях. Встречаются варианты написания «Коперцев» и «Каперцов» — это следствие акающего произношения (о вместо а в безударном слоге) или ошибок переписчиков. Фамилия не относится к дворянским, её носители — в основном крестьяне и мещане.

Интересная деталь: по модели образования фамилия Каперцев похожа на фамилии вроде Стрельцов, Кузнецов, но с той разницей, что основа «капер» не профессиональная, а прозвищная. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна эта фамилия не упоминается, что подтверждает её локальный и редкий характер. Если ваш предок носил такую фамилию, скорее всего, он жил в южнорусских губерниях и получил прозвище от односельчан за какой-то характерный поступок или черту — возможно, за любовь к спорам или неугомонность.