Фамилия Карабардин (встречается и вариант Карабердин) стоит в ряду известных русских фамилий тюркского происхождения — таких как Тургенев, Аксаков или Булгаков. Её основа — тюркское составное имя Караберди. Первая часть, «кара», означает «чёрный» или «грозный, могучий». Вторая часть, «берди», восходит к глаголу со значением «дал» или «рождённый» — в мусульманских именах этот компонент часто осмыслялся как «бог дал». Таким образом, имя Караберди можно перевести и как «чёрный рождённый» (прозвище по внешности — для темноволосого и черноглазого мальчика), и как «рождённый могучим» (имя-пожелание силы и власти).

Фамилия образована по типичной восточнославянской модели: к тюркскому имени Караберди добавили русский патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Караберды). Фонетический переход «е» в «а» во втором слоге (Карабердин → Карабардин) — результат аканья, то есть произносительной нормы, при которой безударный звук «е» звучит как «а». Такая замена в письменных источниках нередка для южнорусских и среднерусских говоров, где фамилия могла закрепиться в народном произношении раньше, чем сложилось единое написание.

В отличие от многих дворянских фамилий тюркского корня (того же Тургенева), фамилия Карабардин не получила широкой известности в родословных книгах. Встречается она преимущественно в Поволжье и на Урале — регионах, где веками шёл активный контакт русского и тюркского населения. Носители фамилии, скорее всего, происходили из служилых людей, крестьян или посадских, а не из аристократии: имя Караберди не было ханским или знатным, а бытовало как обычное личное прозвище или мусульманское имя в простонародной среде.