Фамилия Карахончев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Карахончев уходит в XV-XVII вв. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Карахончев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Фамилия Карахончев восходит к мусульманскому мужскому имени Карахон. Оно образовано от тюркского слова qara, т.е. «черный, смуглый; грозный, сильный», и узбекского han — «хан, правитель». Таким образом, дословный перевод имени Карахон будет приблизительно выглядеть как «грозный и сильный правитель». Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Карахончев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Тем не менее, фамилия Карахончев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.