Фамилия Каракинова — женская форма от Каракинов. В основе почти наверняка лежит прозвище или дохристианское имя тюркского происхождения. Разбираем корень «карак»: в тюркских языках это слово означает «черный» (как цвет), а также «зрачок», «глаз». В переносном смысле «карак» могло быть прозвищем темноволосого, смуглого человека или того, кто славился острым зрением. Вторая часть, «ин», — типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («чей?» — Каракинов, то есть сын Каракина). Получается, что Каракинов — это «сын человека по прозвищу Карака» или «сын Каракина», где Каракин — уже адаптированная русская форма тюркского имени.

Модель образования фамилии — суффикс -ин, характерный для русского Севера и Поволжья. Он крепится к основе, оканчивающейся на -а или согласный. Здесь основа «Каракин» — имя или прозвище, которое само образовано от «Карака» с помощью того же суффикса принадлежности. Такая двухступенчатая конструкция встречается нечасто и говорит о глубокой укорененности прозвища в быту.

Географически фамилия Каракинова наиболее вероятна в регионах с сильным тюркским влиянием: Татарстан, Башкортостан, Оренбуржье, а также среди казанских татар, башкир или мишарей. В русской среде она могла появиться через крещение тюркских народов, когда родовое имя становилось фамилией. Альтернативная, но менее вероятная версия связывает корень с каракалпаками (народ «черные шапки») или топонимом Карака, но в случае с фамилией личное прозвище — самый прямой путь.

Если отбросить тюркскую этимологию, можно вспомнить, что в некоторых русских говорах «карака» означало «коряга», «кривое дерево» — тогда прозвище дали бы некрасивому или сутулому человеку. Но для Поволжья тюркская версия и по частоте, и по логике словообразования намного убедительнее. Носительница фамилии Каракинова может с высокой долей уверенности считать, что ее предки жили на стыке культур и носили имя, связанное с внешностью или зоркостью.