Фамилия Каракай восходит к тюрско-татарскому обрядовому имени Каракай, которое образовано путем присоединения к слову «кара» («черный») уменьшительно-ласкательного суффикса -кай. Такое имя давалось смуглому, черноволосому мальчику. Менее вероятно, что в основе фамилии Каракай лежит аналогичное прозвище, которое, в свою очередь, происходит от древнетюркского слова «qaraq» - «глаз». Возможно, Каракаем называли человека с большими глазами.