Фамилия Карамакакин — одна из тех, о происхождении которых можно строить только догадки, но эти догадки ведут в интересные стороны. С первого взгляда бросается в глаза её необычная структура: она явно состоит из двух частей, соединённых гласной «а». Первая часть — «Карамак-», вторая — суффикс «-ин», который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Карамакакин, то есть сын или потомок Карамакаки.

Самый вероятный корень лежит в тюркских языках. Слово «кара» (чёрный, тёмный) — один из самых распространённых компонентов в тюркских прозвищах и именах. Вторая часть «-мак» может восходить к тюркскому глаголу со значением «бить, ударять» или к имени Махмуд (в сокращённой форме Мак). Таким образом, «Карамак» могло быть прозвищем человека с тёмной внешностью («чёрный удар»? «тёмный Махмуд»?) или отражать какое-то свойство характера. Однако есть и другая, более прозаичная версия: «карамак» в некоторых тюркских диалектах означает «каракуль» (шкура ягнёнка) или «чёрный мех». Тогда прозвище Карамака мог получить скорняк, торговец мехом или просто человек, носивший такую шапку.

В русской среде фамилии на «-ака» (Карамака, Балака, Мазака) нередко возникали из прозвищ, образованных от глаголов с суффиксом «-ака»: «карамакать» — то есть делать что-то с особым усердием или неуклюже. Это могло быть местное диалектное слово, не дошедшее до литературного языка. Если так, то Карамакакин — это потомок человека, которого в деревне прозвали Карамакой за его манеру речи или работы.

С географической точки зрения фамилия редкая и, скорее всего, имеет южнорусские или поволжские корни — там, где исторически было сильное тюркское влияние и где фамилии с суффиксом «-ин» от прозвищ на «-а» обычны. Точно сказать, к какому сословию принадлежали первые Карамакакины, невозможно: такие фамилии встречались и у крестьян, и у однодворцев, и у казаков. Но ясно одно: прозвище было ярким и запоминающимся, раз закрепилось в таком необычном виде.