Фамилия Карамалькин — один из тех случаев, когда внешне «нерусский» корень на самом деле указывает на вполне славянское происхождение, но с восточным колоритом. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Карамалька, которое, скорее всего, происходит от тюркского слова «карамал» — в ряде тюркских языков так называют чёрный скот или, в переносном смысле, смуглого, темноволосого человека. Суффикс -к- в прозвище (Карамалка) — уменьшительно-ласкательный, типичный для русских обиходных имён. А вот суффикс фамилии -ин — классический русский патронимический показатель, отвечающий на вопрос «чей?». То есть Карамалькин буквально означает «сын Карамальки».

География бытования фамилии подсказывает, что предки носителей жили в зоне активных русско-тюркских контактов. Наибольшая концентрация Карамалькиных исторически фиксируется в Поволжье — в Татарстане, Башкортостане, Самарской и Оренбургской областях. Это регионы, где русские крестьяне и казаки веками соседствовали с татарами и башкирами, заимствуя у них не только слова, но и прозвища. Встречается фамилия и у мордвы-эрзи, что тоже объяснимо: финно-угорские народы Поволжья часто перенимали тюркские антропонимы.

Интересная деталь: написание фамилии через «а» во втором слоге (Карамалькин, а не Коромалькин) указывает на сохранение тюркского вокализма. В русских говорах такое слово могли бы «акать» и произносить как «Карамалька», но на письме закрепился именно вариант, близкий к исходному «кара» — «чёрный». Если бы фамилия возникла от русского диалектного слова «коромысло», мы бы видели вариант Коромылькин, но этого не произошло.

Сословно Карамалькины, скорее всего, относились к государственным или экономическим крестьянам, реже — к однодворцам (служилым людям по прибору). Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не значится. В дореволюционных метрических книгах фамилия встречается в записях о крестьянах села Русский Кандыз (сейчас Оренбургская область) и деревни Старая Карамала (Самарская губерния) — что прямо указывает на топонимическую параллель: название села и фамилия могли возникнуть от одного корня.

В современной России Карамалькиных немного, фамилия редкая. Её носители живут в основном в тех же регионах, где она возникла, — в Башкортостане и Татарстане, а также в Москве и Санкт-Петербурге, куда переехали потомки поволжских крестьян.