Фамилия Карекин, скорее всего, имеет тюркские корни. В её основе лежит прозвище Карека, которое восходит к слову «кара» — «чёрный» в большинстве тюркских языков. Модель образования проста: к прозвищу на твёрдый согласный добавили русский патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность («сын Кареки»). Получается, что первый носитель фамилии был чьим-то потомком человека с прозвищем Карека.

Значение прозвища могло быть разным. «Чёрный» в тюркских прозвищах часто указывало на тёмный цвет волос или кожи. Но у слова «кара» был и переносный смысл: «простой, чернь», иногда «сильный» или «грозный». В тюркской ономастике прозвища с «кара» встречаются повсеместно, и русские фамилии на -ин от них не редкость. Та же модель, что и у фамилии Карекин, работает в фамилиях Карамзин (от Карамза — «чёрный, смуглый») или Каримов (от Карим, но с другим суффиксом).

Интересно, что фамилия Карекин не входит в число самых массовых русских фамилий, но её география бытования широка. Она встречается не только в регионах с тюркским населением, но и в центральной России. Это говорит о том, что прозвище могло закрепиться за человеком, который переехал из тюркоязычной среды в русскую, или за русским, получившим такое прозвище за внешность.

По аналогии с известными фамилиями — Тургенев от «турген» (быстрый), Аксаков от «аксак» (хромой), Булгаков от «булгак» (беспокойный) — Карекин стоит в том же ряду. Это типичный пример того, как тюркское по происхождению прозвище, описывавшее внешность или характер, превратилось в русскую фамилию через простой суффикс принадлежности.