Фамилия Карегин — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, описывало не внешность или занятие человека, а его манеру речи. В основе фамилии лежит глагол «карекать», который в ряде южнорусских и украинских говоров означал «каркать», «говорить сипло, хрипло» или «ворчать». Человека с таким голосом или привычкой постоянно недовольно бурчать могли прозвать Карега, а его потомки стали Карегиными.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей сын?» — сын Кареги. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. Если бы основа заканчивалась на твёрдый согласный, появился бы суффикс -ов (Карегов), но здесь сработало окончание основы, и мы видим именно -ин.

Есть и вторая, менее вероятная версия, которую стоит упомянуть ради объективности. В некоторых говорах «карега» могло означать «коряга», «кривое дерево» — тогда прозвище давали сутулому или неуклюжему человеку. Однако эта версия слабее: слово «коряга» в диалектах чаще звучало как «коряга» или «каряга», а вариант с «е» встречается реже и может быть вторичным искажением.

Фамилия Карегин — не массовая. Она встречается в основном в Центральной России и Поволжье, что подтверждает её русские корни, а не заимствование из других языков. В дворянских родословных книгах она не значится — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали метко и без лести. Карегу, вероятно, запомнили по голосу: либо он картавил, либо говорил так, что его «карканье» слышала вся деревня.