Фамилия Качегин образована от прозвища или нецерковного имени Качега. В её основе, скорее всего, лежит глагол «качать» — в северных и сибирских говорах так называли непоседливого, вертлявого человека, «качегу» — того, кто постоянно в движении. Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть Качегин буквально означает «сын Качеги». Это типичная «патронимическая» фамилия, причём с довольно редкой основой: она не от крестильного имени, а от живого народного слова.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским корнем «кач» (бежать, убегать) или «качы» (беглец). Однако для фамилий центральной России такое происхождение нетипично, а Качегины, по данным переписей, встречаются в основном в Вятской и Костромской губерниях — исконно русских регионах. Поэтому версия с русским диалектным прозвищем выглядит убедительнее.

Интересная деталь: в тех же вятских говорах «качегой» называли ещё и ухват — рогатую палку для вытаскивания чугунов из печи. Если прозвище дали не за характер, а за занятие, то предок Качегин мог быть кузнецом, ковавшим ухваты, или просто человеком, который постоянно орудовал этим предметом — например, печником. В любом случае, фамилия недвусмысленно отсылает к быту и языку русского Севера.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Качалов, Качалкин) подтверждает, что все они образованы от глагола «качать», но Качегин — самая редкая из них. В дореволюционных списках фамилия почти не фиксируется за дворянскими родами, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение её носителей.