Фамилия Качегов, скорее всего, имеет тюркские корни и восходит к прозвищу, как и многие известные русские фамилии — Тургенев (от «быстрый, скорый»), Аксаков (от «хромой») или Булгаков (от «беспокойный»). В основе фамилии лежит тюркское слово «качыг» или «качкын», что означает «беглец», «беженец» или «беглый». Прозвище Качег могли дать человеку, который бежал от какой-либо опасности, покинул родные места или был изгнанником.

Суффикс -ов указывает на модель образования отчества: Качегов — буквально «сын Качега». Это типичная для русских фамилий форма, закрепившаяся в XVI–XVII веках. Если бы прозвище было образовано напрямую от слова «качег» (в значении «весло» или «гребля»), фамилия, скорее всего, звучала бы иначе — например, Качегин.

Географически фамилия Качегов встречается в Поволжье и на Урале — регионах, где исторически было сильное татарское и башкирское влияние, а русское население активно контактировало с тюркскими народами. В документах XVII века упоминаются служилые люди и крестьяне с такой фамилией в Казанском и Уфимском уездах.

Версия о происхождении от русского слова «качать» (качели, качка) менее правдоподобна: в этом случае прозвище дали бы человеку с характерной походкой или привычкой, но тюркская этимология объясняет фамилию точнее и подтверждается историческим контекстом.