Фамилия Качегина образована от мужского прозвища или имени Качега. Такие именования с суффиксом -ега — редкая, но характерная для славянской ономастики словообразовательная модель. Подобные фамилии встречаются у восточных, западных и южных славян, но в русской среде они нечастотны, что делает Качегина ценной находкой для этимолога.

Основа «качег» могла иметь несколько источников. Самая прямая версия — от древнерусского глагола «качать» или «качнуть»: Качегой называли человека, который любил раскачиваться, ходить вразвалку или, в переносном смысле, неустойчивого в решениях. В северных говорах «качега» — это неловкий, неуклюжий человек, что тоже могло закрепиться как прозвище.

Вторая версия отсылает к тюркскому корню «кач» (бежать, убегать). Если предок был беглым крестьянином или переселенцем, его могли прозвать Качегой — «беглец». В пользу этой гипотезы говорит активное взаимодействие русских с тюркскими народами в XVI–XVII веках, когда фамилии только начинали закрепляться.

Третья, менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с профессией. В некоторых диалектах «качег» означало рычаг для подъема тяжестей, так могли прозвать силача или работника, занятого на погрузке. Однако эта версия слабая: профессиональные прозвища обычно образовывались с суффиксом -арь/-чик, а -ега характернее для личных характеристик.

Фамилия принадлежит к типично русскому типу на -ин, указывающему на принадлежность: «чей?» — «сын Качеги». Женская форма Качегина — исходная для носительницы, мужская — Качегин. Поскольку фамилия редкая, её география узкая: единичные записи встречаются в Вологодской и Костромской областях, что совпадает с ареалом бытования северных говоров, где слово «качега» фиксируется в значении «неуклюжий человек».

Сословная принадлежность носителей не реконструируется из-за малочисленности фамилии. Можно предположить, что предки были крестьянами или посадскими людьми — фамилии на -ега обычно не встречаются в дворянской среде. В документах XIX века Качегины не значатся среди купечества или духовенства, что косвенно подтверждает простонародное происхождение.