Фамилия Карго в русском контексте — редкий гость, и её происхождение почти наверняка не связано с привычной славянской моделью «прозвище + суффикс принадлежности». В ней нет ни -ов, ни -ин, ни -ский. Это указывает либо на позднее заимствование, либо на искусственное происхождение (например, изменение фамилии при записи), либо на то, что перед нами фамилия неславянского корня, которая бытует в русской среде.

Самый прямой путь — от французского cargo, что значит «груз». Но это слово пришло в русский язык через морскую и торговую лексику лишь в XIX–XX веках. Вряд ли крестьянину или мещанину в глухой деревне дали бы прозвище «Груз». Вероятнее, что фамилия Карго — это русифицированная форма тюркской или кавказской фамилии. Например, у народов Северного Кавказа есть фамилии, звучащие как Каргов или Каргоев, где основа может восходить к тюркскому «кар» — «снег», или к имени собственному. В таком случае Карго — это усечённый вариант, который мог появиться при переписи или в советских документах, когда окончание отбросили или не записали.

Встречается фамилия Карго и у немецких колонистов в России. В немецком языке Kargo — вариант фамилии Karg, что означает «скупой» или «скудный». Переселенцы из Германии в Поволжье и Причерноморье нередко получали при адаптации упрощённые формы, и Карго могла закрепиться как фамилия одного из родов. Этот вариант объясняет, почему носители фамилии могут встречаться в южных регионах России, где были немецкие колонии.

Единой версии нет. Но если отталкиваться от частотности, то для русской среды Карго — скорее всего, либо позднее заимствование по созвучию с иностранным словом (например, кто-то из предков работал в порту или на железной дороге и получил прозвище Карго), либо сокращённая форма от более длинной фамилии. В любом случае, это не «крестьянская» фамилия в традиционном понимании, а скорее городская или пришлая.