Фамилия Карклитис — редкий случай, когда географическое происхождение очевидно, а смысл основы — нет. Это типичная латышская фамилия с патронимическим суффиксом -ит (-ītis), который в латышском языке образует уменьшительно-ласкательные или «сыновьи» формы, примерно как русские -ов/-ев. Собственно, Карклитис — это «маленький Карклис» или «сын Карклиса». В латышской ономастике фамилии на -ит (-ītis) чрезвычайно распространены (сравните: Берзиньш, Озолиньш, Калниньш), и Карклитис вписывается в этот ряд.

Корень «каркл-» отсылает к латышскому слову kārkls — «ива», «ракита». В латышских фамилиях ботанические мотивы — одни из самых частых: Берзиньш (берёза), Озолиньш (дуб), Лиепиньш (липа). Карклитис, таким образом, скорее всего, означал «ивовый» или «живущий у ив». Прозвище могли дать человеку, жившему в низине, у реки, поросшей ивой, или же тому, кто занимался плетением из ивовых прутьев.

Версия о происхождении от личного имени Карклис (возможно, от того же корня) менее вероятна, но не исключена: в латышской народной традиции имена от названий деревьев встречались. Важно, что фамилия не русская и не славянская — суффикс -ит (-ītis) чётко указывает на латышский ареал. В дореволюционных документах, особенно в Курляндской и Лифляндской губерниях, фамилия писалась по-русски как Карклит или Карклитис, а в латышском оригинале — Kārklītis (с долгой «а» и долгой «и»). Носители фамилии — потомки латышских крестьян, чаще всего батраков или арендаторов, поскольку в Латвии фамилии закрепились за крестьянскими родами лишь после отмены крепостного права в 1819 году. Дворянских корней у Карклитис нет — это фамилия сельская, корнями уходящая в природу.