Фамилия Карноушенков — редкий пример, где исходное прозвище, скорее всего, было связано не с профессией или внешностью, а с манерой поведения или речью. Основа «карноух» в русских говорах означала человека с обрезанным, изуродованным или коротким ухом. Однако в переносном смысле так могли назвать того, кто «недослышит» — прикидывается глухим или просто невнимателен. В говорах слово «карноухий» фиксировалось и в значении «упрямый, своенравный»: человек, который слышит только то, что хочет.

Модель образования двойная. Сначала от прозвища Карноух через суффикс -енк- возникла фамилия Карноушенко — типичная для украинской и южнорусской традиции (суффикс -енко указывал на потомка: «сын Карноуха»). Затем, при продвижении фамилии в великорусские земли, к ней добавили «великорусский» суффикс -ов. Так появилась форма Карноушенков — буквально «внук или потомок Карноуха». Подобная цепочка (украинская основа + русский суффикс) встречается у фамилий вроде Гончаренков, Коваленков и говорит о миграции носителей с юга на север.

В написании фамилии есть одна особенность: буква «ш» в суффиксе. Исходное «Карноух» дало бы «Карноухов», но здесь сработала украинская фонетическая модель: «х» перед «е» перешло в «ш» (как в словах «вухо» — «вушенко»). То есть фамилию произносили и писали по слуху, а не по строгим правилам русского словообразования.

Географически фамилия тяготеет к южным областям России и востоку Украины. Встречается она нечасто, и большинство её носителей — выходцы из крестьянской или казачьей среды, где прозвища были особенно живучи. Сословных перегородок у фамилии не было: Карноушенковыми могли быть и однодворцы, и бывшие крепостные. Единственное, что их объединяло — память о предке, который либо носил шрам на ухе, либо слыл человеком себе на уме.