Фамилия Касаркин — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а прозвище, связанное с внешностью или характером. Она образована по стандартной для русских фамилий модели: к основе «Касарк» добавили суффикс принадлежности -ин, указывающий на «сына Касарки» или «человека из семьи Касаркиных». Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Касаркин.

Исходное прозвище Касарка, по наиболее убедительной версии, восходит к слову «касарка» — так в некоторых русских говорах, особенно на юге и в Поволжье, называли человека с косыми, раскосыми глазами. Слово это — родственное диалектному «касы́й» (косой) и, возможно, связано с тюркскими заимствованиями, где похожие корни означают «кривой», «слепой на один глаз». Таким образом, первый носитель прозвища мог получить его за особенность зрения или разреза глаз. В старину такие прозвища давали без злого умысла — просто как отличительную примету.

Менее вероятна, но не исключена связь с названием птицы «казарка» (через чередование з/с). В этом случае прозвище могло быть дано человеку за сходство с этой птицей — например, за длинную шею или манеру держаться. Однако в русской ономастике фамилии от названий птиц обычно сохраняют исходный корень (Гусев, Лебедев, Казаркин), а форма «Касаркин» с глухим «с» указывает на диалектное произношение, что сильнее привязывает её к прилагательному со значением «косой».

Встречаемость фамилии невысокая, что типично для прозвищных фамилий, не перешедших в массовые. Основные очаги бытования — южнорусские области (Курская, Воронежская, Ростовская), а также регионы, где исторически смешивались славянские и тюркские говоры. Сословной принадлежности у Касаркиных не было: крестьяне, однодворцы, реже мещане. Никаких громких исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано — она осталась в крестьянской среде и не попала в дворянские родословные книги.