Фамилия Кайтуковы — один из примеров того, как тюркские имена и прозвища прижились на русской почве и со временем превратились в наследственные родовые именования. Скорее всего, её основа — мужское имя Кайтук, бытовавшее у карачаевцев и балкарцев. Если разбирать это имя по составу, то в нём видны два корня: «къайад» (брак, супружество) и «туг» (кровь). Вряд ли речь идёт о прямом значении «кровь брака», скорее это метафора, подчёркивающая крепость родственных уз.

Формант «-ов» в фамилии указывает на стандартную русскую модель образования — по отцу. То есть первоначально Кайтуков — это «сын Кайтука». Такая модель в XV–XVII веках активно вбирала в себя имена и прозвища из тюркской среды, особенно среди служилых людей и дворянства, которое пополнялось выходцами из Золотой Орды, от печенегов или половцев.

Менее убедительно выглядит версия, связывающая фамилию с киргизским «кайтуу» — «возвращение». Здесь слабое место в том, что слово не образует характерного антропонима (личного имени), а без имени фамилия вряд ли могла возникнуть. Поэтому карачаево-балкарское имя Кайтук остаётся основной и самой правдоподобной гипотезой.

Точных сведений о сословной принадлежности Кайтуковых нет, но сам факт, что фамилия фиксируется в родословных записях, говорит о том, что её носители входили в число тех, кто оставил след в документах. Как и многие фамилии с «восточным следом», Кайтуковы — памятник сложных культурных связей, которые формировали русское общество на протяжении нескольких столетий.