Фамилия Кайтова — женская форма фамилии Кайтов, и в её основе лежит прозвище или нецерковное имя Кайт. Чтобы понять, откуда оно взялось, нужно разобрать несколько возможных корней, и самый убедительный из них — тюркский.

В тюркских языках, особенно в татарском и башкирском, слово «кайт» означает «возвращение», «приход домой». Прозвище Кайт могли дать ребёнку, родившемуся после долгого отсутствия отца (например, с войны или с промысла), или долгожданному, «вернувшемуся» в семью после череды неудач. Такая модель имянаречения была широко распространена у поволжских татар и башкир, а фамилия Кайтов/Кайтова — типичный пример русификации тюркского имени через суффикс -ов/-ев.

Существует и менее вероятная, но возможная версия, связанная с русскими диалектами. В некоторых говорах «кайт» или «кайта» — это вид плетёной корзины или рыболовной снасти. В этом случае фамилия могла произойти от прозвища мастера, который такие корзины плёл, или от человека, который ими торговал. Однако эта версия уступает тюркской: во-первых, слово «кайт» в значении «корзина» — редкое и локальное, а во-вторых, фамилии на -ов, образованные от названий предметов, обычно не имеют такого узкого распространения.

Фамилия Кайтова встречается в основном в регионах с сильным татарским и башкирским влиянием: в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. Это косвенно подтверждает тюркскую версию происхождения. Её можно поставить в один ряд с фамилиями, образованными от других «возвратных» имён — например, Кайтанов или Кайтуков, хотя у каждой из них есть свои нюансы.

В официальных документах фамилия закрепилась, скорее всего, в XIX веке, когда крестьянам и жителям национальных окраин массово присваивали фамилии по отцу — то есть по отчеству. Если отца звали Кайт, его дети записывались как Кайтовы. Сегодня носительницы фамилии Кайтова могут быть потомками как поволжских татар, принявших православие и русифицировавших фамилию, так и русских переселенцев, перенявших прозвище от соседей-тюрков.