Фамилия Казтуганов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если разбить её на части, то яснее становится только суффикс: -ов указывает на русскую модель образования отчества или прозвища («чей?» — сын Казтугана). А вот основа «Казтуган» требует разбора.

Здесь возможны две версии, и обе связаны с тюркскими языками. Первая: имя или прозвище Казтуган могло состоять из двух корней — «каз» (гусь) и «туган» (рождённый, родной). В тюркской ономастике нередки имена, образованные от названий птиц: гусь считался символом плодородия или храбрости. «Казтуган» в таком случае — «рождённый гусём» или «гусиный родич», что могло быть тотемным прозвищем.

Вторая версия: «каз» здесь — не птица, а глагольная основа со значением «копать, рыть» (ср. казахское «қазу» — копать). Тогда «Казтуган» — «рождённый, чтобы копать» или «тот, кто копает». Такое прозвище могли дать землекопу, рудокопу или человеку, жившему у рва или канала. Однако эта версия менее вероятна: личные имена с глагольной основой «копать» в тюркской антропонимии почти не встречаются.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически смешивались тюркские и русские традиции именования — Поволжье, Урал, Западная Сибирь. У татар, башкир или казахов нередко встречаются фамилии на -ов, образованные от тюркских личных имён. В этом смысле Казтуганов — типичный пример адаптации тюркского прозвища в русскую фамильную систему.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) эта фамилия не фиксируется — она вне основного массива, что подтверждает её редкость и локальный характер. Носителей Казтугановых немного, и в открытых источниках известных исторических личностей с такой фамилией нет. Это обычная ситуация для фамилий, возникших в небольших сельских общинах и не попавших в дворянские родословные книги.

Если принять первую версию, то предок носителя фамилии мог получить имя Казтуган по тотемному признаку — как «гусиный сын». Такие имена в тюркской среде давали либо по внешнему сходству (например, длинная шея), либо по поведению (крикливый, важный), либо по родовому культу. Со временем имя превратилось в отчество, а затем — в фамилию, закрепившуюся за потомками.